热带作物学报

作者：郑斌,文定青,武红霞,邹明宏,刘恒,王松标,赵巧丽

单位：中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/国家热带果树种质资源圃/农业农村部热带果树生物学重点实验室,广东湛江 524091

关键词：芒果,bHLH家族,转录因子,生物信息学

基金：广东省自然科学基金-粤东西北创新人才专项(2016A030307006),国家重点研发计划项目(2017YFD0202107),热带果树种质资源收集、鉴定、编目、繁殖更新与保存分发利用专项()

bHLH家族作为植物中较大的转录因子家族之一,在真核生物生长发育调控中具有重要作用。本研究基于芒果果实转录组数据,利用生物信息学方法鉴定出87个bHLH家族蛋白,其中酸性蛋白所占比例较大,大部分为不稳定蛋白,且均为不含信号肽的亲水性蛋白,除CL10714.Contig1为膜结合转录因子外,其余均不含跨膜结构。芒果bHLH蛋白结构域有多个氨基酸位点保守性较高,87个芒果bHLH蛋白中73个（83.91%）具有E-box结合功能。GO分析发现芒果bHLH蛋白共注释到生物学过程、细胞组分和分子功能3大类功能的17个亚类。进化树分析发现芒果bHLH蛋白与拟南芥有较高的保守性,并基于进化树对部分bHLH蛋白的功能进行了预测。本研究结果将为下一步芒果bHLH蛋白的功能研究奠定基础。

来源：2019年第2期

《热带作物学报》期刊编辑部

查看热带作物学报杂志2019年第2期