热带作物学报

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国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2019年第8期:利用小RNA测序技术检测贵州西番莲病毒

发布日期:

作者:严佳文,袁启凤,解璞,王立娟,马玉华,王正媛

单位:1. 贵州省农业科学院果树科学研究所,贵州贵阳 550006,2. 罗甸县果业产业化发展办公室,贵州罗甸 550100

关键词:西番莲,病毒,小RNA测序,鉴定

基金:贵州省农科院青年基金(黔农科院青年基金[2018]23号),贵州省重点科技攻关项目(黔科合NZ[2015]3001号),贵州省科技攻关项目项目(黔科合支撑[2107]2570-1号)

病毒病害是西番莲重要病害之一,明确病毒种类可为病害防治提供理论依据。本研究应用小RNA测序技术对6份疑似病毒侵染的西番莲叶片样本进行病毒种类鉴定,发现混合样本中含有黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus, CMV)和夜来香花叶病毒(Telosma mosaic virus, TeMV)。应用RT-PCR分别扩增6份样本中2种病毒的外壳蛋白(coat protein, CP)基因序列,进一步证实6份样本中均含有CMV和TeMV。CMV的CP基因开放阅读框大小为657 bp,与已报道的其他分离物的一致性为82.3%~95.9%;TeMV的CP基因开放阅读框为816 bp,与其他分离物的一致性分别为87.8%~99.3%和87.8%~98.3%。上述结果表明,贵州西番莲中的病毒是CMV和TeMV的分离物,分别命名为CMV-GZ(CP基因登录号为MH623077)、TeMV-GZ1(MH623078)和TeMV-GZ2(MH623079)。

来源:2019年第8期

《热带作物学报》期刊编辑部

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