热带作物学报

作者：李慧峰,黄咏梅,李彦青,滑金锋,吴翠荣,范继征,陈天渊

单位：广西农业科学院玉米研究所,广西南宁 530007

关键词：甘薯,种质资源,SLAF-seq,遗传进化分析

基金：广西农业科学院基本科研业务专项(桂农科2017YM12),国家现代农业产业技术体系广西创新团队建设专项(No.nycytxgxcxtd-11-03),现代农业产业技术体系建设专项(No.CARS-10-C19)

基于简化基因组测序技术对122份甘薯种质资源进行分析,开发SNP位点并将其应用于种质资源群体结构和遗传进化分析。结果表明, 从122份甘薯种质资源中共获得563.18 Mb读长,不同材料的读长数量在1 419 809~8 392 785范围之间。测序质量值Q30在90.61%~96.82%之间,平均Q30为92.78%。测序获得的GC含量在36.46%~40.33%之间,平均GC含量为38.17%,对照GC含量为40.72%。根据测序结果共开发出高质量的SLAF标签2 388 759个,平均测序深度为17.45×。其中,多态性的SLAF标签77 761个,占SLAF标签总数的3.26%。根据所获得多态性SLAF标签统计SNP位点信息,共计获得129 063个群体SNP位点。遗传进化分析表明122份种质资源可以分为3个大类,分类结果与它们的地理来源无直接关系,聚类结果可为甘薯育种亲本组配和杂种优势利用提供科学依据。

来源：2019年第12期

《热带作物学报》期刊编辑部

查看热带作物学报杂志2019年第12期