热带作物学报

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国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2020年第1期:广东雷州杂草稻sh4和qSH1基因的功能SNP位点序列分析

发布日期:

作者:夏启玉,曹扬,孔华,李美英,张丽丽,贺萍萍,张雨良,郭安平

单位:中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业农村部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室/海南省南繁生物安全与分子育种重点实验室,海南海口 571101

关键词:杂草稻,落粒性,sh4,qSH1,序列分析

基金:海南省自然科学基金青年基金项目(319QN304),中国热带农业科学院基本科研业务费专项(1630052017012),中国热带农业科学院基本科研业务费专项(1630012019008)

sh4和qSH1基因是水稻的主效落粒基因,本研究旨在测定雷州杂草稻的sh4和qSH1的基因型,为雷州杂草稻的落粒机制研究提供分子基础。本研究从雷州10个杂草稻群体采集了100个单株及10份栽培稻种子,观测其颖壳颜色、果皮颜色和芒及落粒率,并对sh4和qSH1的功能SNP位点进行PCR扩增及序列分析。结果表明,57份杂草稻的sh4功能SNP位点为野生落粒型(G),15份为杂合型G/T,28份为突变难落粒型(T)。其中,G型和G/T型的72份杂草稻的落粒率都极高(95%~100%),而28份T型杂草稻中,19份为中度落粒(30%~75%),5份杂草稻的落粒率很高(>95%),4份杂草稻的落粒率小于30%。100份杂草稻和10份栽培稻的qSH1功能SNP位点均为G。结合落粒表型及基因型,推测sh4是调控雷州杂草稻落粒性的一个主要基因。

来源:2020年第1期

《热带作物学报》期刊编辑部

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