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国内刊号：46-1019/S
国际刊号：1000-2561
发布日期:
作者：孙熹微,范海阔,弓淑芳,刘蕊,纠凤凤,肖勇
单位： 海南大学热带作物学院,海南海口 570100, 中国热带农业科学院椰子研究所/海南省热带油料作物生物学重点实验室,海南文昌 571339
关键词：ZF-HD基因家族,椰子,生物信息学
基金：中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金“重要热作种质资源收集、保存、评价和创新利用团队-椰子基因型鉴定”(1630152017007)
ZF-HD蛋白是一类只存在于植物体内且含有锌指结构域的转录因子家族,其不仅能够调节植物的生长发育,且在植物响应逆境过程中也起着重要的作用。本研究通过比对已开发的椰子基因组数据,共鉴定出20个椰子ZF-HD蛋白。采用生物信息学的方法,对其基因结构、蛋白理化性质、蛋白质保守结构域、超二级结构、系统进化树及表达谱进行分析。结果显示：椰子ZF-HD蛋白多为碱性蛋白,且主要定位于细胞核、叶绿体及线粒体中。椰子ZF-HD基因家族可分为6个亚族,每个亚家族都具有相似的结构域和超二级结构。motif搜索分析显示,CoMIF亚族只含有锌指结构域保守序列,其他亚族均含有锌指结构域序列与同源异形盒结构域序列。表达谱分析显示,CoZHD18、CoZHD20在测序的各组织中表达较少,其他家族成员在各组织中的表达量具有差异性。
来源：2020年第2期
《热带作物学报》期刊编辑部
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