国内刊号:46-1019/S
国际刊号:1000-2561
发布日期:
作者:卢新喜,罗聪,张秀娟,余海霞,刘源,何新华
单位:广西大学农学院/广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,广西南宁 530004
关键词:芒果,CONSTANS,MiCOL6,基因克隆,生物信息学分析,表达模式分析
基金:广西创新驱动发展专项资金(桂科AA17204097-3),广西重点研发计划项目(桂科AB17292010),国家现代农业产业技术体系广西芒果创新团队栽培岗位项目(nycytxgxcxtd-06-02)
CONSTANS(CO)是光周期途径的核心调控因子,其可以整合光质和生物钟输出的信号调控植物成花。在前期转录组研究的基础上,设计基因特异性引物,通过RT-PCR扩增得到芒果的1个CO基因的cDNA全长,序列长度为678 bp,根据与拟南芥CO家族基因的相似性,将其命名为MiCOL6。生物信息学分析显示,该基因编码226个氨基酸,分子量为26.88 kDa,等电点为4.85,属于亲水性的非分泌蛋白。保守结构域和进化树分析显示,该基因仅含1个CCT结构域,属于CO基因家族的第4组;二级结构分析表明,该蛋白主要以无规卷曲和α-螺旋为主;亚细胞定位预测显示该蛋白定位在细胞质膜上的概率最大;不同花发育时期表达模式分析表明,MiCOL6基因在杧果的花芽分化期表达量最高。本研究结果为进一步研究芒果MiCOL6基因在芒果中的功能提供理论基础。
来源:2020年第4期
《热带作物学报》期刊编辑部