热带作物学报

作者：王珧,邓逸桐,戴习彬,张安,曹清河,陈艳丽

单位：1.海南大学园艺学院,海南海口 570228,2.江苏徐淮地区徐州农业科学研究所,江苏徐州 221131

关键词：甘薯,Ipomoea cordatotriloba,基因组大小,流式细胞法,K-mer计算

基金：国家重点研发计划项目(2018YFD1000705),国家重点研发计划项目(2018YFD1000701-5),国家自然科学基金项目(31461143017),江苏省农业种质资源保护与利用平台项目(JSGB2018-03)

利用流式细胞术,以大豆Williams 82为内参,对甘薯近缘野生种Ipomoea cordatotriloba进行基因组大小测定,结合染色体压片技术进行倍性鉴定,并利用二代高通量测序技术对测定结果进行验证。结果表明:利用流式细胞术测得I. cordatotriloba基因组大小为(539.69±13.76)Mb;染色体压片结果显示其染色体数目为30条,由于其基数x=15,从而获知I. cordatotriloba为二倍体;经K-mer计算并修正后得出的C值为560.70 Mb,与流式细胞分析结果相近;同时,测序结果显示其基因组杂合率为0.40%;重复序列比率为57.93%;GC含量为38.10%。以上结果为此物种全基因组精细图谱绘制打下基础,同时为甘薯近缘野生种的利用提供参考。

来源：2020年第6期

《热带作物学报》期刊编辑部

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