热带作物学报

北大核心,JST,CSCD扩展版,WJCI,

国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2020年第6期:艾纳香脱氢酶基因家族的生物信息学分析

发布日期:

作者:白琳,官玲亮,查英,于福来,王凯,谢小丽,庞玉新,陈松笔

单位:1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业农村部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室/海南省艾纳香工程技术研究中心,海南儋州 571737,2.黑龙江八一农垦大学农学院,黑龙江大庆 163319

关键词:艾纳香,艾纳香脱氢酶(BbADH),氨基酸序列,保守区,系统发育分析

基金:国家自然科学基金项目(31870317),海南省自然科学基金项目(2019RC316),中国热带农业科学院基本科研业务费(1630032020041)

采用RT-PCR和RACE(Rapid amplification of cDNA ends)技术,从艾纳香(Blumea balsamifera (L.) DC.)叶片中克隆到4条编码艾纳香脱氢酶(BbADH1、BbADH2、BbADH3、BbADH4)基因的cDNA序列,并对4条核苷酸及其编码的氨基酸序列进行生物信息学分析。结果显示:4条艾纳香脱氢酶序列开放阅读框均在900 bp左右,蛋白质等电点(pI)值在5.0~9.0之间,含量最多的氨基酸为亮氨酸(Leu),最少的为色氨酸(Try),具有明显的疏水区和亲水区,N端未发现信号肽,且无跨膜区;同源性比对结果显示,艾纳香BbADH蛋白与其他植物中ADH蛋白具有高度的相似性,且具有脱氢酶的特征功能域;系统发育分析表明,艾纳香(B. balsamifera (L.) DC.)BbADH1和BbADH3同处于一个分支,且与胡杨(Populus euphratica Oliv.)PeADH物种亲缘关系较近,而艾纳香BbADH4和BbADH2处于不同分支,且分别与葡萄(Vitis vinifera)VvADH和烟草(Nicotiana tabacum)NtADH物种亲缘关系较近。

来源:2020年第6期

《热带作物学报》期刊编辑部

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