热带作物学报

作者：官玲亮,查英,白琳,于福来,陈振夏,陈晓鹭,谢小丽,王凯,黄梅

单位：1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/海南省艾纳香工程技术研究中心,海南海口 571101,2.黑龙江八一农垦大学农学院,黑龙江大庆 163319

关键词：艾纳香,MYB转录因子,生物信息学

基金：国家自然科学基金项目(31870317),海南省自然科学基金项目(2019RC316),中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金(1630032020041)

MYB转录因子是植物中庞大的转录因子家族之一,在植物体内有着广泛的生物学功能。基于艾纳香全长转录组数据库,利用DNAMAN 6.0、MEGA 5.05软件以及ProtParam、WebLogo和SOPMA在线网站分析艾纳香MYB转录因子家族蛋白的分类、理化性质、氨基酸序列高级结构、保守结构域、系统进化等。结果表明,挖掘到127个BbMYB基因,预测47条具有MYB转录因子保守结构域的蛋白序列;根据结构域可分为1R-BbMYB和R2R3-MYB 2个亚类,其中R2-BbMYB与R3-BbMYB基序中都含有3个保守的色氨酸,而R1-BbMYB基序只有2个保守的色氨酸;艾纳香MYB家族蛋白均为亲水性蛋白,热稳定性较高且富含碱性氨基酸,大部分蛋白以无规则卷曲为主,其中R2R3-BbMYB3、R2R3-BbMYB4与1R-BbMYB15蛋白是以α-螺旋为主;与拟南芥MYB转录因子家族共同构建的进化树发现,艾纳香MYB家族在进化上包括2个大类,6个亚类,通过艾纳香与拟南芥MYB蛋白序列相邻或是进化关系近可以预测艾纳香MYB基因功能,为进一步对艾纳香MYB家族基因研究及其功能鉴定提供科学依据。

来源：2020年第7期

《热带作物学报》期刊编辑部

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