热带作物学报

作者：潘敏,于旭东,蔡泽坪,李佳佳,罗佳佳,周丹,楚文清,瞿倩

单位：1.海南大学林学院/热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室,海南海口 570228,2.海南大学热带作物学院,海南海口 570228,3.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业农村部热带作物种质资源利用重点实验室,海南儋州 571737

关键词：菠萝蜜,全长转录组,功能注释

基金：海南省自然科学基金项目(319MS017),现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-11-HNCYH),海南大学科研启动基金项目(kyqd1620)

菠萝蜜（Artocarpus heterophyllus）是热带地区重要的木本植物,具有较高的经济价值。试验以菠萝蜜正常及叶绿素合成缺失突变体幼苗为研究材料,在PacBio Sequel平台上进行茎叶全长转录组测序,最终得到95 701个Isforms,在对转录本进行聚类纠错后利用NR、NT、GO、KOG、KEGG、Swiss-Prot、InterPro 7个数据库进行功能注释,共有93 367个转录本被注释。七大数据库中分别有92 187（NR）、90 326（NT）、74 548（Swiss-Prot）、75 396（KEGG）、77 022（KOG）、81 906（InterPro）和65 500（GO）个转录本获得功能注释。共检测到85 091个CDS和55 608个SSR序列,并预测到了4 753个转录因子（Transcription Factors,TFs）,1 667个转录调控子（Transcriptional Regulators,TRs）以及4 710个受体激酶（Receptor-like Kinases,RLKs）。

来源：2020年第7期

《热带作物学报》期刊编辑部

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