热带作物学报

作者：沈婕, 董世满, 李淑霞, 彭明

单位：1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 海南海口 571101,2.海南大学热带作物学院,海南海口 570228

关键词：木薯,低温胁迫,lncRNA,功能分析,同源性分析,RNA二级结构预测,共表达基因分析,靶基因

基金：国家自然科学基金青年基金项目(31701484),国家自然科学基金国际合作与交流项目(31561143012),国家重点研发计划项目(2018YFD1000500)

低温胁迫严重影响木薯的生长、产量以及块根品质。长链非编码RNAs（lncRNAs）作为关键的调节因子,在植物响应非生物胁迫过程中发挥重要的功能。然而,lncRNAs在木薯中的功能和调控机制尚无报道。因此,为了研究木薯lncRNAs在低温胁迫应答中的功能,本研究以木薯主栽品种‘60444’为材料,利用低温处理前后的叶片转录组数据,鉴定到一个受低温胁迫调控的lncRNA（cold-responsive lncRNA5,CRR5）。通过对其序列比对进行同源性分析, RNA二级结构预测和共表达分析鉴定来分析lncRNA-CRR5响应低温胁迫的分子功能。并根据基因的共表达分析推测CRR5的顺式作用和反式作用靶基因。这些结果为更进一步研究CRR5的功能提供了理论依据。

来源：2021年第1期

《热带作物学报》期刊编辑部

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