国内刊号:46-1019/S
国际刊号:1000-2561
发布日期:
作者:刘红坚, 李松, 何为中, 刘俊仙, 刘丽敏, 卢曼曼, 游建华, 黄诚华, 林善海
单位:广西农业科学院甘蔗研究所/中国农业科学院甘蔗研究中心/农业农村部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室,广西南宁 530007
关键词:甘蔗,组培苗,污染细菌,芽孢杆菌,系统发育树
基金:广西创新驱动发展专项资金项目(桂科AA17202042-3),广西农业科学院稳定资助团队项目(桂农科2018YT04),广西农业科学院基本科研业务专项(桂农科2017YM05)
细菌污染是甘蔗组培苗生产上的一个主要问题。为明确甘蔗组培中常出现的污染细菌的种类,本研究通过梯度稀释的方法分离污染细菌,结合生化特性、16S rRNA和phaC基因序列比对及系统发育分析鉴定其分类地位。结果表明,共分离获得2种不同类型污染细菌,除了甘露醇,其余9个生化指标完全一致。基因序列比对发现,2种类型分离物的种内2个基因序列完全一致,而种间16S rRNA序列只有2个碱基差异,种间phaC序列有23个碱基差异。2个基因序列构建的系统发育树显示,2种细菌遗传距离较近,并均能形成独立的2个分支。结合生化特征、序列比对及系统发育树,将2种污染细菌分别鉴定为巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)和阿氏芽孢杆菌(B. aryabhattai),且首次报道阿氏芽孢杆菌为甘蔗组织培养中的污染细菌。本研究揭示了巨大芽孢杆菌可能来源于甘蔗的内生菌,而阿氏芽孢杆菌来源于环境。
来源:2021年第2期
《热带作物学报》期刊编辑部