热带作物学报

北大核心,JST,CSCD扩展版,WJCI,

国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2021年第2期:菠萝NAC转录因子基因AcoNAC1生物信息学及表达分析

发布日期:

作者:谭秦亮, 蔡元保, 杨祥燕, 李穆, 李季东, 黄思婕, 程琴, 庞新华, 朱鹏锦, 周全光

单位:1.广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西南宁 530001,2.广西农垦甘蔗研究所,广西南宁 530001

关键词:菠萝,NAC转录因子,生物信息学分析,逆境胁迫

基金:广西自然科学基金项目(2019GXNSFAA245010),广西农业科学院基本科研业务专项(桂农科2020YM55),广西农业科学院基本科研业务专项(桂农科2021YT153),广西直属公益性科研院所基本科研业务费专项(桂热研201903)

NAC转录因子作为植物中数量最大的转录因子家族之一,在植物生长发育及各种逆境胁迫中发挥非常重要的调控作用。本研究以菠萝为试验材料,采用RT-PCR技术克隆得到基因AcoNAC1(GenBank登录号:XM_020225830),对其进行生物信息学及表达分析。生物信息学分析表明,该基因cDNA序列全长1723 bp,ORF为1062 bp,编码353个氨基酸,相对分子量为38.34 kDa,理论等电点为8.88;其编码蛋白的二级结构由20.40%的α-螺旋(H)和15.30%的β-折叠(E)以及59.21%的无规则卷曲(C)组成,具有NAC典型结构保守域。基因表达分析表明,AcoNAC1基因的表达受低温和干旱胁迫诱导,低温胁迫24 h和干旱胁迫12 h时的表达量最高;在不同成熟期品种中表现出持续的诱导表达,但诱导强度逐渐下降,其中早熟品种谢花后20~50 d及晚熟品种谢花后20~60 d基因表达量均处于较高水平。因此,推测AcoNAC1基因可能参与菠萝逆境胁迫响应以及果实发育与成熟的调控。

来源:2021年第2期

《热带作物学报》期刊编辑部

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