热带作物学报

北大核心,JST,CSCD扩展版,WJCI,

国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2021年第3期:基于trnH-psbA和matK序列的不同种油茶种苗DNA条形码分析

发布日期:

作者:代佳妮, 于靖, 戚华沙, 郑蔚, 王健, 吴友根, 赖杭桂, 胡新文

单位:1.海南大学园艺学院,海南海口 570228,2.海南大学热带作物学院,海南海口 570228

关键词:trnH-psbA序列,matK序列,油茶,DNA条形码

基金:海南省自然科学基金高层次人才项目(820RC585),海南省重大科技计划项目(ZDKJ2017004)

为有效鉴别出不同种油茶种苗,收集101份不同种油茶种苗作为试材,其中18份越南油茶、79份普通油茶、1份博白大果油茶、3份红花油茶,利用叶绿体基因组trnH-psbA和matK序列进行扩增并测序分析,随后对序列进行拼接及特征分析,并计算样本种间及种内遗传距离,构建系统发育树。结果表明:101份供试材料的trnH-psbA序列全长381 bp,有10个变异位点,可通过变异位点鉴别出越南油茶、红花油茶及部分普通油茶,系统发育树将越南油茶聚为一支,自展支持率为64%;matK序列全长797 bp,有5个变异位点,可通过变异位点鉴别出越南油茶、红花油茶及部分普通油茶,系统发育树将红花油茶聚为一支,越南油茶聚为一支,自展支持率分别为65%和64%。因此,trnH-psbA序列可对越南油茶进行有效鉴别,而matK序列可对越南油茶和红花油茶进行有效鉴别。该研究结果对避免油茶种苗混杂、规范海南油茶种苗市场有一定的指导意义。

来源:2021年第3期

《热带作物学报》期刊编辑部

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