国内刊号:46-1019/S
国际刊号:1000-2561
发布日期:
作者:姚全胜, 杨倩, 柳凤, 詹儒林
单位:中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/海南省热带园艺产品采后生理与保鲜重点实验室,广东湛江 524091
关键词:芒果,细菌性角斑病,内切葡聚糖酶,克隆,序列分析
基金:国家重点研发计划项目(2019YFD1001100),中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1630062020014)
由柑橘黄单胞菌芒果致病变种(Xanthomonas citri pv.mangiferaeindicae, Xcm)引起的芒果细菌性角斑病是芒果上的一种重要的细菌性病害。利用同源基因克隆技术克隆了Xcm上内切葡聚糖酶(endoglucanase)基因CEL的全长,经测序后运用多种生物信息学软件对其序列进行分析。结果表明:CEL基因的完整阅读框包含1134 bp,编码377个氨基酸;预测分子量为40.72 kDa;等电点为9.01;不稳定指数39.93,为稳定蛋白;亲水性为-0.081,有信号肽;总磷酸化位点有51个,无跨膜螺旋;在二级结构预测中,α-螺旋、β-转角、无规则卷曲和延伸结构分别为35.28%、6.10%、16.45%和42.18%。经保守结构域预测,具有Cellulase保守结构域。系统进化树结果显示,该基因的氨基酸序列与X. citri pv. punicae str. LMG 859(CCF67690.1)的亲缘关系最近。以gyrB、GAPHD和rpoD作为内参基因,经qRT-PCR分析CEL在Xcm侵染芒果叶片12 h后表达量持续上升,明显高于对照,在72 h处为最大表达量,由此推断该基因在病菌侵染时发挥重要作用。
来源:2021年第4期
《热带作物学报》期刊编辑部