热带作物学报

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国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2021年第5期:橡胶树‘热研7-33-97’死皮相关研究的qRT-PCR内参基因筛选

发布日期:

作者:卢亚莉, 张世鑫, 杨署光, 田维敏, 史敏晶

单位:中国热带农业科学院橡胶研究所/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室,海南海口 571101

关键词:橡胶树,死皮相关,内参基因,qRT-PCR

基金:国家重点研发计划项目(2018YFD1000502),国家自然科学基金项目(31870590),现代农业产业技术体系建设专项(CARS-33-YZ1)

在橡胶树死皮以及死皮康复相关研究中,为获得可靠的基因表达结果,筛选合适的内参基因显得尤为重要。本研究以‘热研7-33-97’健康树、三级死皮树和死皮康复树为试验材料,收集其中的胶乳,采用qRT-PCR技术,结合GeNorm、NormFinder和BestKeeper三种内参筛选软件,综合分析了20个候选内参基因在不同胶乳样品中的表达情况。结果表明:eif2、ACT7a、UBC2b在健康树中较稳定;UBC3、eifAb、eifAa、ADF4、UBC4、UBC2b、eif2、RH2b、ACT7b在三级死皮树中较稳定;UBC2b、eif2和ROC3在三级死皮恢复树中较稳定。选择胶乳代谢相关基因HbDXS1、HbHMGS2和HbNIN3对候选的内参基因进行验证,筛选出本研究中适合的一组稳定可靠的内参基因是eif2和UBC2b,其中ejf2是最佳内参基因,18S不适合作为本研究的内参基因。

来源:2021年第5期

《热带作物学报》期刊编辑部

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