热带作物学报

作者：张燕梅, 李俊峰, 杨子平, 鹿志伟, 陆军迎, 周文钊

单位：中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/湛江市热带作物遗传改良重点实验室,广东湛江 524091

关键词：剑麻,转录组测序,SSR

基金：广东省甘蔗剑麻产业技术体系创新团队(2019KJ104-03),国家麻类产业技术体系项目(CARS-16),中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金(1630062019021)

本研究基于剑麻转录组测序获得的70 110条Unigene序列,采用MISA 1.0软件查找SSR位点,利用Primer 3.0设计SSR引物,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对其中的100对SSR引物有效性进行验证。总计获得了13 175个SSR位点,SSR的分布频率为15.61%。70 110条Unigene序列总计包括60种重复基元,其中单核苷酸重复为主导重复类型（37.96%）,其次是二核苷酸重复和三核苷酸重复,比例分别为32.92%和27.90%,四核苷酸、五核苷酸、六核苷酸重复所占比例总计为1.21%。A/T、AG/CT和AGG/CCT分别为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复的优势基元。100对SSR引物中有68对引物可扩增出目标产物,其中18对引物在6份剑麻种质中表现出多态性,该结果为利用SSR分子标记技术开展剑麻种质资源鉴定、遗传多样性分析等奠定基础。

来源：2021年第5期

《热带作物学报》期刊编辑部

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