热带作物学报

北大核心,JST,CSCD扩展版,WJCI,

国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2021年第5期:‘六月早’蜜柚叶绿体基因组及其特征分析

发布日期:

作者:徐世荣, 陈燕琼, 潘东明, 潘鹤立

单位:1.福建农林大学园艺产品贮运保鲜研究所,福建福州 350002,2.福建农林大学园林学院,福建福州 350002

关键词:琯溪蜜柚,叶绿体基因组,SSR,系统发育

基金:福建省科技厅区域发展项目(2017N3005),福建省发改委农业“五新”工程项目(闽发改农业[2018]114号),福建农林大学第三批科技创新专项基金项目(2017-71)

‘六月早’蜜柚(Citrus maxima ‘Liuyuezao’)为国内重要的柚品种琯溪蜜柚早熟芽变品种。以‘六月早’蜜柚为材料,利用二代测序进行全基因组重测序,从中组装获取叶绿体基因组并对其进行注释。结果表明:组装获得的‘六月早’蜜柚的叶绿体基因组全长160 186 bp,四分体结构由大单拷贝区(large single copy, LSC)、小单拷贝区(small single copy, SSC)和反向重复区(inverted repeat, IR)组成,3个分区的长度分别为87 939、18 395、26 926 bp。注释得到133个基因,其中包含89个编码基因,37个tRNA和8个rRNA。共识别到31个短串联重复序列,101个SSR位点。将已公开发表的29个芸香科叶绿体基因组使用最大似然法进行系统发育关系的构建,结果表明,‘六月早’蜜柚与甜橙(C. sinensis)、柠檬(C. limon)和C. platymamma的亲缘关系较近。

来源:2021年第5期

《热带作物学报》期刊编辑部

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