热带作物学报

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国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2021年第9期:芒果SEPALLATA3基因的生物信息学与表达分析

发布日期:

作者:谢小杰, 余海霞, 范志毅, 黄方, 刘源, 莫啸, 曾学梅, 何新华, 罗聪

单位:广西大学农学院/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,广西南宁 530000

关键词:芒果,SEPALLATA3,生物信息学,启动子,表达模式

基金:国家自然科学基金项目(31660561),国家自然科学基金项目(31860541),亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室自主研究课题(SKLCUSA-a201906)

SEPALLATA3(SEP3)属于MADS-box基因家族,与植物的成花时间和花器官分化有关。在本研究中,从芒果转录组数据中挖掘获得了2个MiSEP3s基因,分别命名为MiSEP3-1和MiSEP3-2。生物信息学分析显示,MiSEP3-1和MiSEP3-2基因的基因组DNA长度分别为4189 bp和3721 bp,2个基因的开放阅读框长度一致均为732 bp,编码244个氨基酸,蛋白质分子量分别为59.29 kD和59.28 kD。2个MiSEP3s的氨基酸序列中含有典型的MADS结构域和K-box结构域。启动子序列分析显示,2个MiSEP3s基因启动子均包含光响应元件、激素响应元件、逆境响应元件和转录因子结合位点,但调控元件种类和数量存在差异。基因表达模式分析显示,2个MiSEP3s基因在营养期的茎、叶和芽中表达量较低,但在成花转变后期的芽中持续上调表达,在花中达到表达高峰。该结果为MiSEP3基因功能的研究提供参考。

来源:2021年第9期

《热带作物学报》期刊编辑部

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