热带作物学报

北大核心,JST,CSCD扩展版,WJCI,

国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2021年第10期:基于TP-M13-SSR标记的石斛兰种质分子身份证构建

发布日期:

作者:肖文芳, 李佐, 陈和明, 吕复兵

单位:1.广东省农业科学院环境园艺研究所,广东广州 510640,2.广东省园林花卉种质创新综合利用重点实验室,广东广州 510640

关键词:石斛,TP-M13-SSR,分子身份证

基金:国家重点研发计划项目子课题(2019YFD1000400),广东省现代农业产业技术体系创新团队项目(2020KJ121),广东省农业科学院学科团队建设项目(202127TD)

利用TP-M13-SSR分子标记,以收集保存的29份石斛兰种质为试材,对其遗传多样性进行分析并构建分子身份证。14对SSR引物在29份种质间共检测出191个等位基因,引物检出率为79.31%~100%;引物多态性信息含量为0.3877~0.9484,平均0.7956;Shannon指数为0.8702~3.1553,平均2.1606。29份种质间的遗传相似性系数为0.3037~ 0.9005,在0.7000处可将全部种质分为6个类群。根据引物通用性和Shannon指数高低,从1对引物开始逐步增加引物数量筛选可将29份种质全部区分的引物组合,最终确定核心引物组合为DoeSSR5+DoeSSR87+DoeSSR97。基于这3对核心引物的扩增结果,将等位基因编码成字符串获得29份石斛兰种质独有、可辨的分子身份证。

来源:2021年第10期

《热带作物学报》期刊编辑部

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