热带作物学报

北大核心,JST,CSCD扩展版,WJCI,

国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2022年第2期:辣椒DNA甲基化修饰酶基因的鉴定与表达特征分析

发布日期:

作者:张颖, 蔡小桃, 谢炳春, 韦丽丽, 徐小万, 张碧佩, 吴智明

单位:1.仲恺农业工程学院园艺园林学院,广东广州 510225,2.广东省农业科学院蔬菜研究所/广东省蔬菜新技术研究重点实验室,广东广州 510640

关键词:辣椒,DNA甲基化,果实发育,非生物胁迫,表达分析

基金:国家自然科学基金项目(32072598),国家自然科学基金项目(31672162),广东省普通高校特色创新项目(2018KTSCX099)

DNA甲基化与去甲基化是表观遗传修饰中一种保守的分子机制,参与植物生长发育、次生代谢和逆境胁迫响应等多种生物过程,受DNA甲基化修饰酶基因的调控。为了解DNA甲基化修饰酶基因在辣椒基因组中的特征,利用生物信息学手段鉴定出14个辣椒DNA甲基转移酶和去甲基化酶基因,并对其进行系统分析。结果表明:辣椒基因组中含10个DNA甲基转移酶和4个去甲基化酶基因,这些基因编码的氨基酸介于294~2037 aa之间,不均匀分布于除6号和11号染色体外的其余10条染色体上,基因所含的外显子数目在1~21之间,关系较近的基因拥有的保守域基本一致。组织特异性表达结果显示,CaCMT1和CaMET1-like在所有组织的表达量均很低,而CaDRM1-like2和CaROS1-like2在所有组织中表达量均较高。通过qPCR分析基因在高温和盐胁迫下的表达模式,对比高温处理的整个时期,发现处理3 h的材料中甲基化修饰酶基因表达量变化最明显,上调最高的基因分别为CaROS1-like2和CaROS1-like1;盐胁迫诱导下的材料在12 h处理时甲基化修饰酶基因最敏感,有9个基因表达量达到峰值,上调最高的基因分别为CaROS1-like2和CaDRM1-like1。本研究为进一步揭示辣椒DNA甲基化修饰酶基因家族在表观遗传学中的调控作用提供理论参考。

来源:2022年第2期

《热带作物学报》期刊编辑部

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