热带作物学报

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国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2022年第8期:利用SSR荧光标记构建37个中国橡胶树栽培品种指纹图谱

发布日期:

作者:位明明, 黄肖, 李维国, 黄华孙

单位:中国热带农业科学院橡胶研究所/国家橡胶树育种中心/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室,海南海口 571101

关键词:巴西橡胶树,品种鉴定,SSR荧光标记,DNA指纹图谱

基金:橡胶品种SSR数据库建设与完善项目(19200035),国家天然橡胶产业技术体系项目(CARS-34)

以37个橡胶树栽培品种为材料,利用SSR荧光标记技术进行DNA指纹图谱的构建和遗传关系分析,构建我国橡胶树栽培品种的SSR指纹图谱。共计筛选和确定出34对SSR引物作为构建橡胶树品种DNA指纹图谱库的核心引物,其中30对SSR引物可用于品种鉴定,4对SSR引物可作为备选引物用于后续新选育品种的鉴定。筛选和确定出的核心SSR引物表现出较高的多态性信息含量(PIC值),其中PIC值高于0.5的引物高达97%,PIC值大于0.7的引物多达12对,PIC值大于0.8的引物有2对。引物rbm28的多态性最高,可作为最佳引物用于鉴定中国橡胶树主栽品系的遗传多样性,其他4条引物HESR025、HESR163、H-084、H-122同时具备较高的杂合率和多态性,可考虑作为备选引物。34对核心SSR引物在37个橡胶树品种中共检测到161个等位变异,平均每对引物检测到5.4个等位基因,平均PIC值为0.65,表现出高度多态性。利用30对核心SSR引物对37份橡胶树品种进行扩增,得到相关品种的准确SSR位点信息,获得包含37个橡胶树品种的标准DNA指纹图谱库,其中33个橡胶树品种均具有唯一的DNA特征指纹,可作为各品种特定的图谱,为橡胶树品种鉴定和育种实践提供依据。

来源:2022年第8期

《热带作物学报》期刊编辑部

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