热带作物学报

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国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2022年第11期:橡胶树树皮miRNA定量表达分析的内参筛选

发布日期:

作者:吴绍华, 张世鑫, 杨署光, 田维敏

单位:中国热带农业科学院橡胶研究所/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室,海南海口 571101

关键词:橡胶树,乳管分化,miRNA,冠菌素,内参基因

基金:海南省基础与应用基础研究计划(自然科学领域)高层次人才资助项目(2019RC334),国家天然橡胶产业技术体系育种技术与方法岗位科学家项目(CARS-33-YZ1)

世界所需天然橡胶主要来自橡胶树,橡胶树的乳管是合成和储存天然橡胶的组织,树干树皮中的次生乳管与天然橡胶生产密切相关,由维管形成层分化而来。次生乳管数量与天然橡胶产量呈显著正相关。因此,乳管分化是天然橡胶生产面临的一个重大理论课题。植物miRNAs是一类长约20~24个核苷酸的非编码小RNA分子,通过介导基因沉默在植物生长发育、细胞分化及逆境适应中起着非常重要的调节作用。橡胶树乳管分化过程中差异miRNAs的鉴定对于进一步认识乳管分化的分子机理具有重要的作用。实时荧光定量PCR(qPCR)已广泛用于miRNA的定量表达分析,选择合适的miRNA内参对于准确进行miRNA的表达定量至关重要。本研究以冠菌素(coronatine, COR)诱导橡胶树萌条分化次生乳管的实验系统,采用小RNA Poly A加尾的qPCR技术分析COR处理对形成层区3个非编码RNA(U6 snRNA、5S rRNA、18S rRNA)和6个miRNA(hbr-miR159b、hbr-miR396b、miR169-x、miR172-y、miR535-x、miR894-x)候选内参的表达稳定性的影响。geNorm和NormFinder软件的联合分析结果显示,表达稳定性最高的是hbr-miR396b和miR894-x,稳定性较差的是U6 snRNA。hbr-miR396b和miR894-x可作为合适的内参基因,用于分析COR影响下的miRNA相对定量表达,为鉴定橡胶树次生乳管分化相关的差异表达miRNAs奠定良好基础。

来源:2022年第11期

《热带作物学报》期刊编辑部

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