热带作物学报

北大核心,JST,CSCD扩展版,WJCI,

国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2023年第4期:黑老虎新品系的SSR指纹图谱构建

发布日期:

作者:邹建文, 饶红欣, 陈灵, 罗先权, 何润华, 陈铭, 何艳

单位:湖南省植物园,湖南长沙 410116

关键词:黑老虎,DNA指纹图谱,遗传多样性,亲缘关系

基金:湖南创新型省份建设专项(2020NK2052),国家林业和草原局生物安全与遗传资源管理专项经费项目(KJZXSA202309),湖南省林业科技创新项目(XLK201815)

由于黑老虎种质的特异性评价以其果实及经济性状为主,未结实时仅依据形态性状较难区分,因此,构建黑老虎DNA指纹图谱有助于黑老虎种质的快速精准鉴定。选择15对引物对20个黑老虎品系进行SSR分析,依据Nei’s(1972)遗传距离,采用非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析,通过位点间的组合构建SSR指纹图谱。结果表明:15对引物在20个黑老虎品系中共扩增出15个位点75个等位基因,每个位点的等位基因数为2~15,其Shannon信息指数(I)为0.199~2.456,多态信息含量(PIC)为0.095~0.894。20个品系间遗传相似系数为0.328~0.891,基于UPGMA聚类可分为2个类群。所有15个位点均不能单独完全区分20个黑老虎品系,以KCZ023位点的区分能力最强;KCZ023与KCZ135、KCZ023与KCZ100以及KCZ023与KCZ147的2位点组合以及28个3位点组合能够将20个品系完全区分。20个黑老虎品系的遗传多样性较丰富,应用3个2位点组合和28个3位点组合能够完全区分各品系,该研究结果可为黑老虎种质鉴定以及杂交亲本选配提供科学依据。

来源:2023年第4期

《热带作物学报》期刊编辑部

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