国内刊号:46-1019/S
国际刊号:1000-2561
发布日期:
作者:万人静, 李琼, 周新成, 李论, 李甜甜, 周俊飞, 李莎, 彭海, 章伟雄, 方治伟
单位:1.江汉大学生命科学学院,湖北武汉 430056,2.江汉大学系统生物学研究院,湖北武汉 430056,3.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南海口 571101,4.中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海南海口 571101,5.三峡工程鱼类资源保护湖北省重点实验室,湖北宜昌 443100,6.中国长江三峡集团有限公司中华鲟研究所,湖北宜昌 443100,7.香港理工大学医疗科技及资讯学系,中国香港 100872
关键词:木薯,分子标记,MNP,品种鉴定
基金:国家重点研发计划项目(2018YFD1000505),海南省重点研发计划科技合作方向项目(ZDYF2020208),三峡工程鱼类资源保护湖北省重点实验室开放课题项目(2021041—ZHX)
MNP(multiple nucleotide polymorphism, MNP)是随着分子标记技术的发展而产生的一种新型分子标记技术。靶向测序基因型技术(genotyping by target sequencing, GBTS)在一个扩增子内仅扩增一个SNP位点,MNP基于GBTS可在一个扩增子内同时扩增多个SNP位点。该技术具有成本低、检测效率高、应用灵活、适应性广等特点,MNP标记可用于育种过程的鉴定。为了建立快速、精准、高效的木薯品种鉴定方法,筛选适用于木薯品种鉴定的MNP分子标记,本研究在全基因组范围内筛选高多态性区域并设计引物,最终在全基因范围内获得623个木薯MNP标记位点,并利用28个木薯品种对木薯MNP标记进行评价。结果表明,MNP标记分型重现性高达100%。MNP标记位点在28个木薯品种中检出(4.07±1.68)种等位基因型,最多具有12种等位基因型。对所有木薯品种进行两两比较时,99.47%(376/378)的品种对间的差异大于46%,比例在0.3%~81.0%之间,均值为71.78%。相较于SNP,MNP具有更好的品种区分能力。综上所述,本研究所开发的木薯MNP分子标记具有较高的重现性、多态性和品种区分能力,可广泛用于木薯的种质资源多样性、新品种培育及品种鉴定等研究。
来源:2023年第12期
《热带作物学报》期刊编辑部