热带作物学报

北大核心,JST,CSCD扩展版,WJCI,

国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2024年第3期:腰果CBF基因家族的鉴定及响应冷胁迫的表达模式

发布日期:

作者:崔恒久, 曾教科, 李雯, 黄海杰, 彭世清, 郭冬, 蒲金基, 周永凯, 李辉亮

单位:1.海南大学园艺学院,海南海口 570228,2.海南热带农业资源研究院,海南海口 571101,3.中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海南海口 571101,4.海南大学海南省热带园艺作物品质调控重点实验室,海南海口 570228,5.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南海口 571101,6.国家热带果树品种改良中心,海南海口 571101

关键词:腰果,低温响应,CBF转录因子,基因家族,qRT-PCR

基金:海南省热带园艺作物品质调控重点实验室开放课题(HNZDSYS(YY)-02),海南省自然科学基金项目(322RC799),国家科技资源共享服务平台项目“国家热带植物种质资源库”

腰果(Anacardium occidentalie Linn)属于典型的热带果树,主要在我国的云南省、海南省等地种植。腰果具有重要的经济价值、社会价值、生态价值,为农民增产创收,实现共同富裕和乡村振兴战略具有重要价值。腰果对于低温十分敏感,在8 ℃时就会受到严重伤害,生长停止。所以低温胁迫是制约腰果生长的重要非生物胁迫。CBF转录因子是植物在应对低温、干旱、盐等非生物胁迫下中发挥重要作用的转录因子。然而CBF基因家族在腰果中的作用尚未阐明,该家族在低温胁迫下的表达模式尚不清楚。本研究对腰果AoCBF基因家族的基本特性进行探究,通过生物信息学方法,在腰果转录组中鉴定并获得6个AoCBF基因家族成员,分别对其系统发育、理化性质、蛋白结构、低温诱导下表达模式和启动子作用元件进行分析。理化性质分析结果表明:6个AoCBF蛋白长度为189~ 334 aa,蛋白分子量为21.31~37.89 kDa,等电点均小于7,表明该蛋白呈酸性,且均包含AP2/ERF结构域。基序分析表明:AoCBF基因存在5个基序,不同AoCBF基因Motif的缺失暗示着相关功能的缺失性。系统发育树分析表明:6个AoCBFs可分为A、B两个亚组,其中A组包含1个基因,B组仅包含5个基因。启动子顺势作用元件分析得出,AoCBF可能参与激素响应及非生物胁迫响应过程。荧光定量表达分析显示,AoCBFs对低温冷胁迫均有不同程度的响应,表明AoCBF在响应低温胁迫生物学过程中发挥着一定的作用。本研究分析了AoCBF基因家族的基本特性,为后续AoCBF的深入研究和应用积累基础数据。

来源:2024年第3期

《热带作物学报》期刊编辑部

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