热带作物学报

北大核心,JST,CSCD扩展版,WJCI,

国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2024年第6期:基于RNA-Seq的甘蔗响应鞭黑粉菌侵染的早花相关基因挖掘

发布日期:

作者:王致远, 梁鸿翠, 蔡健和, 陈保善, 许雄彪

单位:1.广西甘蔗生物学重点实验室,广西南宁 530004,2.广西大学农学院,广西南宁 530004,3.广西农业科学研究院植物保护研究所,广西南宁 530007,4.亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,广西南宁 530004

关键词:甘蔗,甘蔗鞭黑粉菌,转录组,开花相关基因

基金:广西自然科学基金项目(2023GXNSFBA026058),广西大学甘蔗专项科研项目(2022GZB011)

甘蔗鞭黑粉菌(Sporisorium scitamineum)是引起甘蔗鞭黑穗病(sugarcane smut)的重要病原菌,侵染甘蔗后通常诱导顶端分生组织产生灰黑色“黑鞭”,在部分甘蔗品种(系)中能诱导植株提前开花,但其作用机制仍不明确。为了探究甘蔗响应鞭黑粉菌侵染的开花相关基因及其表达模式,本研究以同期健康和感染鞭黑粉菌的桂糖42甘蔗品种为实验材料进行转录组测序分析,共筛选出了3276个显著差异表达基因,其中1677个基因上调表达(P<0.05),1599个基因下调表达(P<0.05)。GO富集分析发现差异表达基因主要集中在生物合成过程、核糖体、核糖核蛋白复合体、核糖体结构成分等小类中。KEGG富集结果显示差异表达基因主要集中在氨基酸的生物合成、嘌呤代谢、碳代谢、吞噬作用等代谢通路。筛选到30个与开花途径相关的差异表达基因,并对其中的FT1、PIE1、GID1、GA20ox-1、GA20ox-2等基因进行了qRT-PCR验证,qRT-PCR结果与转录组测序结果基本一致,验证了转录组测序结果的可靠性。本研究结果为解析甘蔗鞭黑粉菌诱导甘蔗提前开花表型的分子机理提供了重要的候选基因,对甘蔗的育种也有重要的参考价值。

来源:2024年第6期

《热带作物学报》期刊编辑部

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