国内刊号:46-1019/S
国际刊号:1000-2561
发布日期:
作者:李娟, 袁渊, 吴挺开, 邓治, 程汉
单位:1.浙江农林大学现代农学院,浙江杭州 311300,2.中国热带农业科学院橡胶研究所/热带作物生物育种全国重点实验室,海南海口 571101,3.中国热带农业科学院三亚研究院,海南三亚 572025
关键词:巴西橡胶树,GRAS基因家族,生物信息学,基因表达,DELLA
基金:海南省自然科学基金高层次人才项目(321RC654),海南省科技人才创新项目(KJRC2023C18),海南省自然科学基金青年基金项目(322QN409)
GRAS是植物特有的转录因子,在植物生长发育过程以及非生物胁迫应答中具有重要的调控作用,然而在巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)中还未见关于该基因家族的报道。本研究利用生物信息学工具分析巴西橡胶树GRAS基因家族成员的蛋白质理化性质、系统进化关系、基因结构、染色体位置及启动子顺式作用元件,利用转录组数据及实时荧光定量PCR(qPCR)分析橡胶树GRAS基因的表达模式。结果表明:在巴西橡胶树基因组中共鉴定到91个GRAS家族成员,分别命名为HbGRAS1~HbGRAS91,其分子量在14.07~89.46 kDa之间。亚细胞定位预测结果显示,HbGRAS蛋白主要定位于细胞核和叶绿体。系统发育分析将其划分为14个亚家族,同一亚族成员的基因结构和基序组成较为保守。橡胶树GRAS基因分布在除11号染色体外的其他17条染色体和2条Scaffold上,其中17个HbGRAS基因组成10个串联重复事件。共线性分析显示,片段重复区域中有87个HbGRAS基因,说明片段重复可能是橡胶树GRAS基因扩张的主要驱动力。启动子顺式作用元件分析显示,橡胶树GRAS家族包含多个植物激素和胁迫应答顺式作用元件。HbGRAS基因表达具有组织特异性,并与橡胶树叶片发育有关。GRAS亚家族成员DELLA基因的表达与橡胶树木质部发育有关并受赤霉素(gibberellin, GA)抑制。本研究结果为橡胶树GRAS基因的功能研究提供参考。
来源:2024年第9期
《热带作物学报》期刊编辑部