热带作物学报

作者：苟志辉, 陈国德, 甄云楠, 王鑫, 陈彧, 田蜜

单位：1.海南省林业科学研究院（海南省红树林研究院），海南海口 571100,2.海南省热带林业资源监测与应用重点实验室，海南海口 571100,3.海口市湿地保护管理中心，海南海口 571100

关键词：沉香,基因组重测序,变异位点,遗传多样性

基金：海南省省属科研院所技术创新专项(KYYSLK2023-006),海南省省属科研院所技术创新专项(SQ-KY2022-0032)

对种质资源信息的掌握是土沉香遗传改良的基础，而基因组重测序是种质资源遗传多样性分析的利器，然而目前学术界缺乏利用基因组重测序对土沉香遗传多样性的研究。本研究在前期收集得到的沉香种质资源基础上，采用基因组重测序，获得60份沉香共1284 Gb重测序数据。利用沉香基因组，共检测得到6 713 166个高质量变异位点，其中SNP位点6 284 344个，Indel位点428 658个。主成分分析、系统发育分析和遗传结构分析均表明，沉香可分为3个显著群体（Pop1、Pop2和Pop3），其中2个群体可分别进一步划分为多个亚群。在3个群体中均检测到群体选择信号，其中Pop3选择信号最多，而核苷酸多态性计算结果表明，Pop3的核苷酸多态性最低。本研究为探究沉香遗传资源多样性提供了有价值的信息，并为基于基因组的沉香遗传育种奠定理论基础。

来源：2025年第1期

《热带作物学报》期刊编辑部

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