热带作物学报

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国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2025年第3期:文心兰软腐病菌Dickeya fangzhongdai Onc5 vfmE基因的克隆及表达分析

发布日期:

作者:王文婷, 任驰, 丁建华, 荆恩荣, 卢秋巍

单位:忻州师范学院生物系,山西忻州 034000

关键词:狄克氏菌,vfmE基因,克隆,生物信息学分析,表达分析

基金:山西省科技厅基础研究计划项目(20210302124516),山西省科技厅基础研究计划项目(20210302124502),山西省高校科技创新计划项目(2021L462)

狄克氏菌(Dickeya fangzhongdai)是引起兰科植物毁灭性病害软腐病(soft rot disease)的主要病原菌之一。病原菌致病基因在病原菌与植物互作中发挥至关重要的作用。软腐病菌D. fangzhongdai Onc5从福建南茜文心兰(Oncidium,Gower Ramsey)软腐病患病植株中分离而来。本研究旨在明确D. fangzhongdai Onc5 vfmE基因的分子生物学特征,并分析其在侵染寄主过程中的作用,为揭示vfmE基因在D. fangzhongdai Onc5侵染寄主过程中的致病机制提供理论依据。本研究以D.fangzhongdai Onc5基因组DNA为模版,通过RT-PCR扩增,成功获得vfmE基因,并进行生物信息学分析;利用RT-qPCR分析vfmE基因在D. fangzhongdai Onc5侵染文心兰过程中的表达情况。结果表明:D. fangzhongdai Onc5 vfmE基因的ORF为564 bp,编码187个氨基酸;vfmE蛋白质的分子质量为21.93 kDa,理论等电点(pI)为9.01,含1个AraC超家族结构域;vfmE蛋白质为结构不稳定的亲水性蛋白,无信号肽,不存在跨膜结构域;其蛋白质二级结构主要为α-螺旋(58.29%)和无规则卷曲(40.64%);同源性分析表明,其氨基酸序列与Dickeya属其他菌种的vfmE序列具有很高的相似性(>86%);RT-qPCR分析表明:vfmE基因在D.fangzhongdai Onc5侵染文心兰叶片和假鳞茎后均持续高表达,在12 h的表达量最高(P<0.01),表明vfmE蛋白在D. fangzhongdai Onc5侵染文心兰的过程中发挥着重要的作用。本研究结果为进一步研究vfmE基因功能和Dickeya属病原菌致病机制提供提论基础,同时也有利于发展植物软腐病新的防治靶标。

来源:2025年第3期

《热带作物学报》期刊编辑部

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