热带作物学报

作者：燕青, 秦雅楠, 张华林, 李文秀, 叶亚娜, 黄安瀛, 罗萍

单位：1.中国热带农业科学院湛江实验站/湛江市橡胶林下经济工程技术研究中心，广东湛江 524013,2.中国林业科学研究院速生树木研究所，广东湛江 524300,3.云南农业大学热带作物学院，云南普洱 650201

关键词：粗叶榕,五指毛桃,转录组,EST-SSR,DNA指纹图谱

基金：国家天然橡胶产业技术体系湛江综合试验站项目(CARS-33-GD2),广西自筹经费林业科技项目(2023GXZCLK13)

五指毛桃（Fici Hirtae Radix）是一种中药材，其来源于粗叶榕（Ficus hirta Vahl.）的干燥根部。开发利用药用植物粗叶榕SSR分子标记，为其种质遗传多样性分析、遗传图谱构建、辅助育种等提供理论依据及数据支撑。以粗叶榕全缘、三裂、五裂、七裂4种典型叶片为试材，经转录组测序后进行位点特征分析及分子标记开发。结果表明：基于34 375条转录组unigene序列，筛选到16 851个SSR位点，分布于12 094条unigene，分布频率为35.18%，平均每2638 bp有1个SSR位点，分布密度为3.68 kb。共观察到5种不同核苷酸基序类型，其中最常见的是重复6次的基序，占SSR总数的20.92%，且长度基本小于29 bp。双碱基重复序列占主导地位，其次是三碱基和四碱基重复类型。其中，(AG/CT)n是最常见的基元，占所有SSR的26.05%；其次是(AT/AT)n基元，占18.69%。随机选取100条EST-SSR引物，以粗叶榕4种不同叶型的基因组DNA扩增目标产物，其中89条引物在粗叶榕4个种质间表现出多态性。选取9对条带清晰的引物，对不同地区的31个粗叶榕种质进行DNA扩增和指纹图谱构建，这些引物组合多态性条带比例均值达72.04%，并对31个种质进行了有效鉴别，成功建立了DNA指纹图谱。研究结果证明粗叶榕转录组SSR位点信息丰富，利用性高，可为后续研究提供数据支撑。

来源：2025年第5期

《热带作物学报》期刊编辑部

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