热带作物学报

作者：刘成, 马关润, 赵明珠, 李梅方, 陈天明, 王静敏, 蒋鑫磊, 白学慧, 周华

单位：云南省德宏热带农业科学研究所，云南瑞丽 678600

关键词：咖啡属,叶绿体基因组,系统发育,高变区

基金：云南省基础研究专项(202401AT070027),云南省重大科技专项计划绿色食品牌重点产业科技创新专项(202202AE090002)

本研究以大粒种咖啡（Coffea liberica）、中粒种咖啡（C. canephora）、小粒种咖啡（C. arabica）、丁香咖啡（C. eugenioides）及总状咖啡（C. racemosa）5种咖啡属植物的叶绿体基因组为研究对象，对其进行统计和比较分析。结果表明：叶绿体基因组长度在154 751~155 189 bp之间，最长的是小粒种咖啡，最短的是中粒种咖啡，GC平均含量为34.98%；大粒种咖啡和小粒种咖啡叶绿体基因组均编码130个基因，丁香咖啡叶绿体基因组编码基因最多，为138个，总状咖啡叶绿体基因组编码基因最少，为121个；比较5种咖啡植物叶绿体基因组边界区域发现，方向顺序排列一致，体现了叶绿体基因组结构的高度保守性；SSR序列分析表明，5种咖啡植物具有较强的AT偏向性，且SSR类型和数目均不相同；经核苷酸多样性变异位点分析，筛选出了5个核苷酸变异较大的区段，包括PetN-PsbM、accD、accD-PsaI、rpl16和ndhF-rpl32。进一步基于叶绿体基因组和5个核酸高变区的联合分析，构建19种咖啡属植物的系统发育树，揭示其亲缘关系。本研究可为咖啡属植物的种质资源鉴定、起源进化及杂交育种提供参考依据。

来源：2025年第5期

《热带作物学报》期刊编辑部

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