热带作物学报

北大核心,JST,CSCD扩展版,WJCI,

国内刊号:46-1019/S

国际刊号:1000-2561

热带作物学报杂志2025年第9期:疏柔毛罗勒精油累积关键MYB的鉴定与挖掘

发布日期:

作者:唐诗淇, 蔡诗曼, 王佳, 钮俊

单位:海南省热带特色花木资源生物学重点实验室/海南大学热带农林学院, 海南儋州 571737

关键词:疏柔毛罗勒,精油,MYB转录因子,黄酮类生物合成

基金:深圳青莲生物科技有限公司项目(HD-KYH-2025107)

MYB是植物中最大的转录因子家族之一,广泛参与植物生长发育、信号传导和次生代谢调控等过程。本研究基于疏柔毛罗勒2+3转录组数据,通过生信手段系统鉴定疏柔毛罗勒的MYB(ObMYB)家族并挖掘与精油累积相关的成员。首先,通过MYB保守结构域同源比对筛选ObMYB家族成员,预测其完整的开发阅读框并分析其基本理化性质;采用MEGA 7.0软件通过邻接法构建系统进化树,结合MEME、Batch CD-Search软件解析蛋白保守结构域特征;随后,结合前期疏柔毛罗勒miRNA组学数据,通过TargetFinder软件预测与ObMYB基因互补的靶向miRNA;最后,运用TBtools软件进行基因差异表达与热图可视化分析,基于茎叶不同发育期的精油数据,通过SPSS 25软件进行差异基因表达量与精油含量的相关性分析,筛选可能参与精油合成累积的关键ObMYB,并利用STRING数据库构建其蛋白互作(PPI)网络以解析可能参与的代谢通路。研究结果显示:共鉴定77个ObMYB成员,分别命名为ObMYB-1~ ObMYB-77,系统进化分析将其划分为8个亚家族(classⅠ~Ⅷ),各亚族含6~14个成员;ObMYB具有典型亲水特性(平均等电点为7.11,平均亲疏水指数为-0.69),多数呈现结构稳定性;5个miRNA可靶向调控4个ObMYB基因;43个ObMYB基因显示差异表达,其中ObMYB-4、ObMYB-9、ObMYB-27、ObMYB-34、ObMYB-42、ObMYB-46及ObMYB-69的表达量与精油积累呈显著正相关;蛋白质互作网络分析表明,ObMYB-4、ObMYB-9、ObMYB-34、ObMYB-36、ObMYB-46和ObMYB-69可能涉及黄酮类生物合成和次生代谢物合成调控。本研究系统鉴定ObMYB家族成员并分析其与精油累积的关系,揭示多个与精油合成和积累显著相关的ObMYB基因,为深入理解疏柔毛罗勒精油代谢调控机制提供重要理论依据,并为植物次生代谢研究和芳香植物品质改良提供新的靶点和思路。

来源:2025年第9期

《热带作物学报》期刊编辑部

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