热带作物学报

作者：薛萌垚, 庞懿瑶, 秦雪莲, 詹若挺, 马新业

单位： 广州中医药大学中药学院/岭南中药资源教育部重点实验室/国家中成药工程技术研究中心南药研发实验室， 广东广州 510006, 岭南现代农业科学与技术广东省实验室茂名分中心， 广东茂名 525000

关键词：降香黄檀,气雾根,转录组,差异表达基因,萜类化合物,黄酮类化合物

基金：岭南现代农业科学与技术广东省实验室茂名分中心基金资助课题(2022ZD010),广东省乡村振兴战略专项-农业科技发展及资源环境保护管理项目-广东省现代南药产业技术体系创新团队(2023KJ14)

降香黄檀是一种珍稀多年生香药两用植物，但其生长周期长且成材缓慢是该植物合理利用与开发的重要限制因素。为了解降香黄檀根系活性成分并对其进行合理利用，本研究以降香黄檀一年生幼苗根为对象，利用气雾栽培技术在短期内获得大量且优质的气雾根。通过高通量测序技术对降香黄檀土培根与气雾栽培根2组根系转录组进行测序及差异比较，挖掘降香黄檀根系次生代谢物合成的关键基因和通路。结果表明，降香黄檀土培根与气雾根比较组中共筛选出7731个显著性差异表达基因（DEGs），其中4447个上调，3284个下调。经GO、KEGG富集分析及GSEA富集分析表明，这些基因主要富集在防御信号转导、氨基酸代谢、次级代谢产物的生物合成等通路。其中倍半萜和三萜生物合成通路、防御信号转导通路在降香黄檀土培根中高表达，氨基酸代谢通路、黄酮类成分生物合成通路在气雾根中高表达。进一步对其相关通路分析，挖掘出降香黄檀次生代谢物合成的相关基因，即黄酮代谢通路中的候选关键差异基因evm.TU.scaffold_100.907、MSTRG.3788、evm.TU.scaffold_233.200、evm.TU.scaffold_111.78、evm.TU.scaffold_5.71与倍半萜合成通路的候选关键差异基因evm.TU.scaffold_36.788、MSTRG.8652、evm.TU.scaffold_40.382、MSTRG.27285、MSTRG.28295。本研究通过比较降香黄檀土培根与气雾根的转录组差异，初步揭示了2组间基因表达层面差异，挖掘其调控次生代谢物合成的基因和通路。通过以上探索，为后续降香黄檀根部资源的深度研发积累数据和提供参考。

来源：2026年第1期

《热带作物学报》期刊编辑部

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